Possuindo uma grande diversidade de ecossistemas, a TNM permite mesmo ao visitante mais desatento, identificar várias espécies de plantas, nomeadamente árvores e arbustos.
Começando pela zona ripícula, passando pelos pinhais, zonas de floresta mista, zonas de matos e até mesmo pelos eucaliptais, todas elas possuem características muito próprias e de grande beleza.
A dominância de determinada espécie varia em função do ecossistema, nomeadamente, disponibilidade de água, tipo de solo, exposição solar, entre outros factores.
As espécies vegetais mais comuns: